ネットワーク可視化ツールの紹介：基本操作編
2008.12.04 Thursday 12:30
井庭 崇
※なお、カンマが区切りの記号なので、ノード名に空白が入っていても問題はない。ただし、空白の数や全角・半角が違うと、別の名前だと判断されるので、同一のノード名にしたい場合には、それらは統一する必要がある。
今回の説明で使用するサンプルデータ(sampledata.csv)は、次のようになっている。このデータは、井庭研究会のメーリングリストにおける投稿の連鎖のデータだ。ある一定期間に、誰が誰の投稿にリプライをしたのかを調べ、上記の形式に直したものだ。１列目の人の投稿に対し、２列目の人がリプライしたということを示している。最後の数字は、期間中にそのような組み合わせが何回あったのかを表している。
Angela,Chuck,1
Angela,Hammer,1
Angela,Hana,1
・
・
・
Hammer,Hana,2
Hammer,Ryo,6
Hammer,Taka,4
・
・
・
Tomo,Chuck,1
Tomo,Miu,1
Tomo,Ryo,2
以下で、説明を読みながら実際に試してみる場合には、まず、サンプルデータ(sampledata.csv)を保存しておこう（右クリックで「名前をつけてリンク先を保存」）。
■データの読み込み
Cytoscapeを立ち上げ、起動画面が終わるのを待つ。[File]メニューから、[Import]→[Network from Table (Text /MS Excel)]を選ぶと、「Import Network and Edge Attributes from Table」ウインドウが表示される。
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