ネットワーク可視化ツールの紹介：基本操作編
2008.12.04 Thursday 12:30
井庭 崇
image[Cyto_Vis_ScreenLayout1.jpg]
■ネットワークのレイアウト変更
データの読み込みが終わると、画面中央にネットワークが可視化されているはずだ。最初に開いたときには、ノードが縦横に整列して配置されていると思う。ここで、ネットワークのレイアウトの変更をしてみよう。
ネットワークのレイアウトの変更は、[Layout]メニューで行うことができる。ネットワークをどのような観点で見たいかによって選択する。[Layout]メニューには、「yFiles」、「Cytoscape Layouts」、「JGraph Layouts」があるが、ここでは、[Cytoscape Layout]→[Edge-weighted Spring Embedded]→[unweighted]を選んでみよう。
image[Cyto_Vis_LayoutSelect.jpg]
これで、リンクのつながり方を反映した配置になったと思う。
image[Cyto_Vis_ScreenLayout2.jpg]
image[Cyto_Vis_LayoutScale.jpg]見た目の基本的な調整としては、スケールを変える、という方法がある。[Layout]メニューから、[Scale]を選ぶと、左下にスケールパネルが開く。そこでスケールを変更することができる。
image[Cyto_Vis_ScalePanel.jpg]
また、上方のツールバーにある「（１：１）の虫眼鏡」を選ぶと、ネットワークの全体像が表示されるように調整してくれる。ネットワーク図のノードをドラッグすると、個々のノードの位置を変えることもできる。
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